Dr Magdalena Perkowska jest doktorem nauk prawnych. Stopień naukowy uzyskała na podstawie rozprawy doktorskiej pt. „Kryminologiczne aspekty przestępczości cudzoziemców na wschodniej granicy Polski” w 2012 roku. W tym samym roku rozpoczęła pracę na stanowisku adiunkta w Katedrze Prawa Karnego i Kryminologii.

Ze względu na swoje zainteresowania naukowe jest członkinią Polskiego Towarzystwa Kryminologii im. prof. Stanisława Batawii, European Society of Criminology, a także Working Group „Criminology of Mobility”, Centrum Badań nad Prawem Migracyjnym Polskiej Akademii Nauk oraz Grupy Badawczej „Inicjatywa Helwecka”. W ciągu kilkunastu ostatnich lat pełniła funkcję koordynatora Programu Erasmus, Pełnomocnika Dziekana Wydziału Prawa ds. Programów Międzynarodowych oraz Sekretarza redakcji czasopisma „Białostockie Studia Prawnicze”.

Jej dorobek naukowy obejmuje obecnie ponad 90 publikacji z zakresu kryminologii i nauk penalnych. Przedstawiła referaty naukowe na kilkudziesięciu seminariach i konferencjach w kraju oraz za granicą. Była wykonawcą w projektach badawczych: „SIC – Modułowy wielozadaniowy System Identyfikacji Cudzoziemców wraz z modułem analizy ryzyka ofiar przestępstwa handlu ludźmi” oraz „Monitoring, identyfikacja i przeciwdziałanie zagrożeniom bezpieczeństwa obywateli”. Aktualnie bierze udział w realizacji projektu „Ryzyko jako zjawisko subiektywne. Włączenie kognitywistki do koncepcji ryzyka w europejskim prawie ochrony danych osobowych”, finansowanego przez Narodowe Centrum Nauki w ramach OPUS-24 (LAP) we współpracy z Vrije Universiteit Brussel. Miała również okazję doskonalić swój warsztat naukowy i badawczy podczas staży zagranicznych na Uniwersytecie w Bernie (Szwajcaria, 2009) oraz na Uniwersytecie w Palermo (Włochy, 2024), a także podczas kilku pobytów szkoleniowych i dydaktycznych w ramach programu Erasmus. Jest stypendystką Ministra Nauki i Szkolnictwa Wyższego dla wybitnych młodych naukowców na lata 2014–2017.

Jej zainteresowania naukowe obejmują zagadnienia związane z kryminologią i prawem karnym, w szczególności przestępczość cudzoziemców, kryminalizację migracji, politykę migracyjną oraz politykę kryminalną. W pracy badawczej koncentruje się na relacjach między polityką migracyjną a kryminalną oraz na zazębianiu się procedur z zakresu prawa karnego i administracyjnego w sprawach dotyczących cudzoziemców. Jej wiedza i prowadzone badania znajdują praktyczne zastosowanie, m.in. w postaci raportów dotyczących zgodności polskiego prawa z prawem Unii Europejskiej, opracowywanych na zlecenie Komisji Europejskiej w projektach: „Study supporting the implementation of the ‘Facilitators Package’”, „Targeted study on the need and potential policy options to better protect third-country nationals under the Seasonal Workers Directive” oraz „SR 21 Fundamental rights compliance at the EU’s external land and sea borders”.